一种蛋白质相互作用位点预测方法及系统

本发明涉及生物信息技术领域，尤其涉及一种蛋白质相互作用位点预测方法及系统。本发明根据蛋白质的序列和结构，提取蛋白质残基特征；利用蛋白质结构构建邻接矩阵，通过集成拉普拉斯特征向量和随机游走，充分表征残基图结构；将残基特征与残基图结构特征拼接作为节点特征，并与邻接矩阵共同构成蛋白质图表征；通过由多个局部结构与全局交互模块构成的残基特征提取模块，进一步学习残基高阶特征，每个局部结构与全局交互模块由残差连接的等变图神经网络和残差连接的空间感知Transformer串联构成；通过多层感知机，对每个残基是否是相互作用位点进行预测分类。本发明充分利用了蛋白质的局部结构信息与全局信息，提高了蛋白质相互作用位点预测的准确性。

《一种蛋白质相互作用位点预测方法及系统》是一发明专利，专利号为 2025110242823，当前法律状态为已下证，由江南大学提出申请，发明人为陈璟;葛笑博;任利军，申请日期为2025-07-24，公开（公告）日期为2026-07-17，国际专利分类号（IPC）为 G16B 20/30 (2019.01)，高新资质：未报高企，所属技术领域包括：生物信息学、蛋白互作位点预测、蛋白质结构分析、机器学习、蛋白结合位点、氨基酸特征、生物序列挖掘、蛋白互作预测、结构生物学、蛋白界面预测、深度学习、生物靶点、蛋白特征提取、序列分析、分子对接辅助。该专利已下发证书，权利稳定，适合直接办理转让过户，是企业申报高企、项目招投标、质押融资的优质标的。赋翼网提供从选品、尽调、合同签订到官方著录项目变更（过户）的一站式专利转让服务，专业顾问全程协助，确保交易合规、安全、高效。专利摘要：本发明涉及生物信息技术领域，尤其涉及一种蛋白质相互作用位点预测方法及系统。本发明根据蛋白质的序列和结构，提取蛋白质残基特征；利用蛋白质结构构建邻接矩阵，通过集成拉普拉斯特征向量和随机游走，充分表征残基图结构；将残基特征与残基图结构特征拼接作为节点特征，并与邻接矩阵共同构成蛋白质图表征；通过由多个局部结构与全局交互模块构成的残基特征提取模块，进一步学习残基高阶特征，每个局部结构与全局交互模块由残差连接的等变图神经网络和残差连接的空间感知Transformer串联构成；通过多层感知机，对每个残基是否是相互作用位点进行预测分类。本发明充分利用了蛋白质的局部结构信息与全局信息，提高了蛋白质相互作用位点预测的准确性。

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