适用于小样本高维度数据的稻瘟病致病基因识别方法
本发明属于生物特征识别技术领域,涉及一种适用于小样本高维度数据的稻瘟病致病基因识别方法,该方法对采集的数据进行处理,得到每个基因所对应样本的表达量,之后进行差异分析,识别出差异表达基因,并根据差异表达基因构建PPI网络,确定与稻瘟病相关的关键基因;最后构建CGAN‑SAE深度学习模型,利用确定的关键基因对CGAN模块进行训练,使CGAN模块能够生成与真实数据难以区分的模拟基因样本数据;再用模拟基因样本与真实样本对SAE模块进行训练,使SAE模块能够捕捉全局特征,最终提取到的特征通过PCA进一步处理,识别出稻瘟病感染过程中的核心基因。该方法解决了在样本数量少,维度高的水稻数据集中进行基因筛选的难题。
《适用于小样本高维度数据的稻瘟病致病基因识别方法》是一发明专利,专利号为 2024118162288,当前法律状态为已下证,由长春大学提出申请,发明人为戴银飞;樊杰;乔梦娇;卢世豪;王绍强;刘玉宝;王艳柏;刘志远;隋玉萍,申请日期为2024-12-11,公开(公告)日期为2025-04-04,国际专利分类号(IPC)为 G16B 20/20 (2019.01),高新资质:未报高企,所属技术领域包括:(水稻种植、稻瘟病、致病基因识别、小样本数据、高维特征、CGAN生成网络、稀疏自编码器、PPI网络、差异表达分析、主成分分析、生物信息学)。该专利已下发证书,权利稳定,适合直接办理转让过户,是企业申报高企、项目招投标、质押融资的优质标的。赋翼网提供从选品、尽调、合同签订到官方著录项目变更(过户)的一站式专利转让服务,专业顾问全程协助,确保交易合规、安全、高效。专利摘要:本发明属于生物特征识别技术领域,涉及一种适用于小样本高维度数据的稻瘟病致病基因识别方法,该方法对采集的数据进行处理,得到每个基因所对应样本的表达量,之后进行差异分析,识别出差异表达基因,并根据差异表达基因构建PPI网络,确定与稻瘟病相关的关键基因;最后构建CGAN‑SAE深度学习模型,利用确定的关键基因对CGAN模块进行训练,使CGAN模块能够生成与真实数据难以区分的模拟基因样本数据;再用模拟基因样本与真实样本对SAE模块进行训练,使SAE模块能够捕捉全局特征,最终提取到的特征通过PCA进一步处理,识别出稻瘟病感染过程中的核心基因。该方法解决了在样本数量少,维度高的水稻数据集中进行基因筛选的难题。
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