基于deBruijn图的肽序列组装方法和装置(高校公示15天)(不包年费滞纳金)(需要二变)
本发明提供一种基于deBruijn图的肽序列组装方法和装置,所述方法包括以下步骤:获取轻重链序列数据,并使用所述轻重链序列数据创建序列比对数据库;将肽序列测试数据进行k‑mer处理,得到k‑mer序列集合;将所述k‑mer序列集合与所述序列比对数据库进行比对,得到比对得分;若所述k‑mer序列集合中是轻重链混合数据,则将所述比对得分分为轻链和重链两类,分别构建deBruijn图,若所述k‑mer序列集合是轻链或者重链数据,则直接构建deBruijn图;在所述deBruijn图中进行序列组装,得到组装好的肽序列。本发明能够将肽序列片段在区分轻重链的条件下进行肽序列组装,组装效率有了很大的提高,组装结果有效可靠。
《基于deBruijn图的肽序列组装方法和装置(高校公示15天)(不包年费滞纳金)(需要二变)》是一发明专利,专利号为 2022107526883,当前法律状态为已下证,由江苏理工学院提出申请,发明人为常珊;陆翼;葛成;蔡标;徐晴;张莉莉;孔韧,申请日期为2022-06-28,公开(公告)日期为2026-02-17,国际专利分类号(IPC)为 G16B 30/10 (2019.01),高新资质:未报高企。该专利已下发证书,权利稳定,适合直接办理转让过户,是企业申报高企、项目招投标、质押融资的优质标的。赋翼网提供从选品、尽调、合同签订到官方著录项目变更(过户)的一站式专利转让服务,专业顾问全程协助,确保交易合规、安全、高效。专利摘要:本发明提供一种基于deBruijn图的肽序列组装方法和装置,所述方法包括以下步骤:获取轻重链序列数据,并使用所述轻重链序列数据创建序列比对数据库;将肽序列测试数据进行k‑mer处理,得到k‑mer序列集合;将所述k‑mer序列集合与所述序列比对数据库进行比对,得到比对得分;若所述k‑mer序列集合中是轻重链混合数据,则将所述比对得分分为轻链和重链两类,分别构建deBruijn图,若所述k‑mer序列集合是轻链或者重链数据,则直接构建deBruijn图;在所述deBruijn图中进行序列组装,得到组装好的肽序列。本发明能够将肽序列片段在区分轻重链的条件下进行肽序列组装,组装效率有了很大的提高,组装结果有效可靠。
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