基于稳健统计与多策略融合的基因序列变异检测方法
本发明涉及基因变异检测技术领域,具体属于一种基于稳健统计与多策略融合的基因序列变异检测方法,包括:比对生成一个已排序的BAM文件;对数据中的缺失值和N位置进行预处理,采用0填充策略替换缺失值,并移除N位置数据;提取RD信号和MQ信号作为特征值;对提取到的RD信号进行GC偏差矫正;对RD信号和MQ信号进行平滑降噪处理;采取两步递进式分割策略,识别具有高度一致性的RD值的连续片段;构建RD信号和MQ信号的二维剖面,并进行标准化处理;串联重复检测并计算异常分数;利用箱线图方法设置阈值,判定异常值;细化串联重复区域。本发明有效解决了低覆盖度测序数据下串联重复变异检测的难题,显著提高了检测的准确性和可靠性。
《基于稳健统计与多策略融合的基因序列变异检测方法》是一发明专利,专利号为 2025103631916,当前法律状态为已下证,由聊城大学提出申请,发明人为董金新;张誉曦;亓民勇;姜华;孙冉冉;杜如超,申请日期为2025-03-26,公开(公告)日期为2025-05-27,国际专利分类号(IPC)为 G16B 20/20 (2019.01),高新资质:未报高企,所属技术领域包括:25年下证基因检测RNADNA检测细胞检测干细胞检测染色体。该专利已下发证书,权利稳定,适合直接办理转让过户,是企业申报高企、项目招投标、质押融资的优质标的。赋翼网提供从选品、尽调、合同签订到官方著录项目变更(过户)的一站式专利转让服务,专业顾问全程协助,确保交易合规、安全、高效。专利摘要:本发明涉及基因变异检测技术领域,具体属于一种基于稳健统计与多策略融合的基因序列变异检测方法,包括:比对生成一个已排序的BAM文件;对数据中的缺失值和N位置进行预处理,采用0填充策略替换缺失值,并移除N位置数据;提取RD信号和MQ信号作为特征值;对提取到的RD信号进行GC偏差矫正;对RD信号和MQ信号进行平滑降噪处理;采取两步递进式分割策略,识别具有高度一致性的RD值的连续片段;构建RD信号和MQ信号的二维剖面,并进行标准化处理;串联重复检测并计算异常分数;利用箱线图方法设置阈值,判定异常值;细化串联重复区域。本发明有效解决了低覆盖度测序数据下串联重复变异检测的难题,显著提高了检测的准确性和可靠性。
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